Российская Федерация вместе с Казахстаном, Китаем, Киргизией, Таджикистаном и Узбекистаном является государством-учредителем Шанхайской организации сотрудничества, созданной в 2001 году.
Активное участие в деятельности ШОС является одним из приоритетов внешней политики России в Азиатско-Тихоокеанском регионе.
На территории Российской Федерации проводились встречи глав государств-участников ШОС - в 2002 году в Санкт-Петербурге, в 2003 году в Москве и в 2009 году - в Екатеринбурге, Совета глав правительств государств-членов ШОС - в 2005 году в Москве, Совета министров иностранных дел государств-членов ШОС - в 2002 и 2004 годах в Москве, руководителей парламентов в 2006 году в Москве.
По предложению российской стороны создан Форум ШОС (площадка для развития взаимодействия научно-исследовательских и политологических центров государств-членов Организации), налажены механизмы Совещания министров обороны и межпарламентского взаимодействия, а также учреждены Деловой совет, Межбанковское объединение.
В 2009 завершился годичный период российского председательства в ШОС. За этот период Организации удалось набрать определенную динамику в своей работе, что было отмечено всеми партнерами. В период российского председательства был проведен целый ряд важных мероприятий. В марте 2009 года в Москве проведена специальная конференция под эгидой ШОС по Афганистану. В апреле-мае 2009 года проведены заседание генеральных прокуроров государств-членов ШОС, встреча секретарей советов безопасности государств-членов ШОС, совещания министров внутренних дел и общественной безопасности, министров обороны и руководителей антинаркотических ведомств государств-членов ШОС. В мае 2009 года в Екатеринбурге по инициативе России пятью государствами-членами Организации был учрежден Молодежный совет ШОС.
В настоящее время совместно с другими государствами-членами прорабатываются такие инициативы, как запуск механизма ведомств, занимающихся вопросами экологии и охраны окружающей среды, создание Центра ШОС по предупреждению природных и техногенных катастроф, Энергетического клуба и Университета ШОС.
В практическую плоскость переведена реализация предложения о включении в повестку дня ШОС проблематики международной информационной безопасности (МИБ), которая приобретает возрастающую актуальность. СГГ ШОС 16 августа 2007 г. в Бишкеке утвердил План действий по обеспечению МИБ. 16 июня 2009 г. в Екатеринбурге подписано межправительственное Соглашение государств-членов ШОС о сотрудничестве в области обеспечения МИБ.
Россия активно сотрудничает с партнерами в рамках Региональной антитеррористической структуры (РАТС) ШОС, инициирует разработку документов, связанных с борьбой с терроризмом, сепаратизмом и экстремизмом, участвует в проводимых РАТС антитеррористических учениях.
В августе 2007 года состоялись первые крупные войсковые антитеррористические учения государств-членов ШОС «Мирная миссия- 2007» (г.Чебаркуль, Челябинская область). В начале сентября 2008 года по линии специальных служб государств-членов ШОС в Волгограде прошли совместные антитеррористические учения «Волгоград-Антитеррор-2008».
Взнос России в бюджет ШОС составляет 24%, соответственно квота российских сотрудников в Секретариате ШОС в Пекине и Исполкоме РАТС в Ташкенте - по 7 человек из 30 (в том числе должности заместителя Генерального секретаря ШОС и заместителя Директора Исполнительного комитета РАТС).