Российская Федерация вместе с Казахстаном, Китаем, Киргизией, Таджикистаном и Узбекистаном является государством-учредителем Шанхайской организации сотрудничества, созданной в 2001 году.
Активное участие в деятельности ШОС является одним из приоритетов внешней политики России в Азиатско-Тихоокеанском регионе.
Российская сторона вносит конструктивный вклад в подготовку и проведение заседаний Совета глав государств, Совета глав правительств (премьер-министров), встреч секретарей советов безопасности, министров иностранных дел государств-членов ШОС, председателей верховных судов, генеральных прокуроров, руководителей профильных министерств и ведомств, инициативно участвует в деятельности экспертных групп по различным направлениям сотрудничества, а также в разработке политических деклараций, совместных заявлений и договорно-правовых документов ШОС.
На территории Российской Федерации проводились встречи глав государств-участников ШОС - в 2002 году в Санкт-Петербурге и в 2003 году в Москве, Совета глав правительств государств-членов ШОС - в 2005 году в Москве, Совета министров иностранных дел государств-членов ШОС - в 2002 и 2004 годах в Москве, руководителей парламентов - в 2006 году в Москве.
По предложению российской стороны создан Форум ШОС (площадка для развития взаимодействия научно-исследовательских и политологических центров государств-членов Организации), налажены механизмы Совещания министров обороны и межпарламентского взаимодействия, а также учреждены Деловой совет ШОС и Межбанковское объединение ШОС.
В настоящее время совместно с другими государствами-членами прорабатываются такие инициативы, как запуск механизма встреч министров внутренних дел и общественной безопасности, ведомств, занимающихся вопросами экологии и охраны окружающей среды, создание Центра ШОС по предупреждению природных и техногенных катастроф, молодежной ассоциации, Энергетического клуба и Университета ШОС.
В практическую плоскость переведена реализация предложения о включении в повестку дня ШОС проблематики международной информационной безопасности (МИБ), которая приобретает возрастающую актуальность. СГГ ШОС 16 августа 2007 г. в Бишкеке утвердил План действий по обеспечению МИБ.
Россия активно сотрудничает с партнерами в рамках Региональной антитеррористической структуры (РАТС) ШОС, инициирует разработку документов, связанных с борьбой с терроризмом, сепаратизмом и экстремизмом, участвует в проводимых РАТС антитеррористических учениях.
В августе 2007 года состоялись первые крупные войсковые антитеррористические учения государств-членов ШОС «Мирная миссия-2007» (г. Чебаркуль, Челябинская область). В начале сентябре 2008 года по линии специальных служб государств-членов ШОС в Волгограде прошли совместные антитеррористические учения «Волгоград - Антитеррор-2008».
Россия уделяет большое внимание расширению взаимодействия в рамках ШОС на афганском направлении. Ведется работа по формированию «поясов» антинаркотической и финансовой безопасности вдоль Афганистана, а также подготовка к созыву под эгидой ШОС специальной конференции по Афганистану.
Взнос России в бюджет ШОС составляет 24%, соответственно квота российских сотрудников в Секретариате ШОС в Пекине и Исполкоме РАТС в Ташкенте - по 7 человек из 30 (в том числе и должности заместителя Генерального секретаря ШОС и заместителя Директора Исполнительного комитета РАТС).