Родился 26 октября 1959 г. в поселке Ориноко департамента Оруро в бедной многодетной крестьянской семье индейцев аймара. В 1978-1979 гг. прошел обязательную воинскую службу. После демобилизации начал активно заниматься профсоюзной деятельностью в объединениях крестьян - производителей коки («кокалерос»). В 1995 г., будучи председателем Координационного комитета шести крупнейших федераций «кокалерос», примкнул к политической партии «Движение к социализму» и вскоре возглавил ее.
В 1997 г. был избран в парламент. В декабре 2001 г. в связи с переходом его партии к радикальным методам протестных действий, Э.Моралес был лишен депутатского мандата. Однако этот факт лишь прибавил ему популярности. В 2002 г. баллотировался на президентский пост, однако уступил тогдашнему фавориту Г. Санчесу де Лосаде около 2% голосов. На выборах 18 декабря 2005 г. Э. Моралес набрал более 50 % голосов и 22 января 2006 г. был приведен к присяге в качестве президента Боливии. На состоявшихся 6 декабря 2009 г. выборах был переизбран на второй президентский срок, одержав безоговорочную победу уже в первом туре (62,3% голосов).