Родился 9 декабря 1963 года в г. Большой Камень Приморского края. После окончания школы поступил в Дальневосточное высшее инженерно-морское училище имени адмирала Невельского (ДВВИМУ) на факультет управления морским транспортом. Во время учёбы работал в порту докером, матросом.
В 1985 году окончил училище с отличием и, поступив в аспирантуру ДВВИМУ, остался на кафедре экономики морского транспорта и морского права заведующим лабораторией.
После аспирантуры работал во Владивостокском морском торговом порту стивидором, начальником смены первого грузового района.
В 1989 году – заместитель директора по организации в АО «Дальлизинг»,
в 1991 году создал и возглавил предприятие «Ролиз» («Российский лизинг»), руководил им вплоть до избрания его губернатором Приморского края. В первые годы своего существования предприятие занималось строительством судов, затем основным направлением деятельности компании стала добыча рыбы.
В 1999 году окончил Дальневосточную государственную академию экономики и бизнеса по специальности «финансы и кредит, экономика».
17 июня 2001 года в ходе выборов губернатора Приморского края набрал наибольшее число голосов избирателей (40,17%). 25 июня 2001 года официально вступил в должность.
28 января 2005 года Президент Российской Федерации внёс на рассмотрение в Законодательное собрание Приморского края кандидатуру С.М.Дарькина на должность губернатора Приморского края. 4 февраля 2005 года наделён полномочиями губернатора.
4 февраля 2010 года Законодательное собрание Приморского края, рассмотрев представленную Президентом Российской Федерации кандидатуру С.М.Дарькина, наделило его полномочиями губернатора на третий срок.
Женат, есть две дочери.