В их числе - «Северо-Восточный федеральный университет имени М.К.Аммосова» (путем изменения типа существующего образовательного учреждения «Якутский государственный университет имени М.К.Аммосова); «Казанский (Приволжский) федеральный университет» (путем изменения типа существующего образовательного учреждения «Казанский государственный университет им. В.И.Ульянова-Ленина»); «Уральский федеральный университет имени первого Президента России Б.Н.Ельцина» (путем изменения типа существующего образовательного учреждения Уральский государственный технический университет -УПИ имени первого Президента России Б.Н.Ельцина»); «Дальневосточный федеральный университет» (путем изменения типа существующего образовательного учреждения «Дальневосточный государственный университет»); «Северный (Арктический) федеральный университет» (путем изменения типа существующего образовательного учреждения «Архангельский государственный технический университет»).
В соответствии с распоряжениями полномочия учредителя этих автономных учреждений осуществляет Минобрнауки России.